ダウンロードしたファイルはstinger.exeです。
オプションなしでこれを実行すると、ウィンドウが開き、そこから駆除作業を実行することになりますが、Tabキーによるフォーカス移動が効かないなど、視覚障害者には少し使いにくい面があります。（ホットキーが設定されているので、使えないことはありませんが。）
そこで、ここでは、「ファイル名を指定して実行」から直接ウィルス検索と駆除を実行することにします。
「ファイル名を指定して実行」から、

B:\Stinger.exe /ADL /GO /LOG /SILENT

を実行します。

/ADLはすべてのローカルドライブの検索、
/GOは、スキャンを開始
/LOGは、ログファイルを保存、
/SILENTは、ウィンドウを表示しないオプションです。

自動的にスキャンがはじまります。
/SILENTオプションを付加しないときは、スキャン開始とともにウィンドウが現れます。終了を感知するのがむずかしいのですが、ClipReaderなどで、ウィンドウのステータスバーの表示を確かめるのがひとつの方法です。Readyに変わったら終了しています。ウィンドウを閉じると、stinger.txtにLOGを保存したというメッセージが出ます。
/SILENTオプションを付加すると、ウィンドウが現れません。この場合、stinger.exeのディレクトリ（B:\)に、stinger.txtが作られたら処理終了です。こちらのほうがわかりやすいのではないかと思い、上記では/SILENTオプションをつけていますが、好みで変更してください。
作成されたログファイルstinger.txtを見れば、ウィルス検出数や、駆除に成功したかどうかがわかるはずです。

上の、BartPEからの駆除でウィルスがうまく除去できた場合、メインシステムを立ち上げて、もう一度、メインシステムから駆除を実行したほうがいいです。
というのは、BartPEからの駆除では、ウィルスファイルは駆除できるものの、レジストリの記述が変更できません。そこでメインシステムのレジストリ記述を正常に戻すため、メインシステムを立ち上げたあと、もう一度、実行する必要があると思います。
駆除に使ったstinger.exeをメインシステムのHDDにコピーしておいて、それを実行すればいいでしょう。

ダウンロードページに説明があるように、stingerはそのときどきに流行している特定のウィルスしか駆除できません。
駆除できるウィルスの一覧は、stingerのウィンドウを開きLキーを押せば表示されます。
stingerで駆除できないときは、他のツールを試さなければなりません。